Miałeś taki komunikat w logu?
HTB: quantum of class 10001 is big. Consider r2q change.

Tak

Okazuje się, że prawdopodobnie jak z poziomu konsoli zrobisz:
tc class change dev ppp3 root classid 1:1 htb rate 4096kbit
to zaczyna działać z prędkością taką jak podana...

Tego nie próbowałem.
Sprawdź jeszcze czy jak zmienisz prędkość z CLI to czy też działa ok.

Możliwe, że jest jakiś problem, gdy podnosi interfejs, albo w samym tworzeniu klas przez accela.
Ja niestety za słabo znam angielski, żeby to opisać twórcy. Może ktoś wrzuci jako BUG, gościu dość szybko reaguje na zgłoszenia.