Ależ żeś "dał po bandzie". Spróbuj jeszcze wpisać USE="mysql" emerge -avD php
przy systemie znajdującym w stage 1. Chcę tylko powiedzieć, że porównanie wykonałeś
błędnie, bo dla php dorzucasz również paczki perlowe, a dla perla tylko paczki perlowe.
Błąd!